临床医学院成立于2017年6月，其前身为2008年4月成立的临床医学系，由此可上溯到1958年创校时举办的医士专业。学院开设有“临床医学”“口腔医学”“预防医学”“公共卫生管理”“医学营养”共5个专业，面向全国19个省市招生，在校学生1000余人。下设科教科、综合科、学生科3个科室和诊断学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、五官科学、预防医学、全科医学、口腔医学9个教研室。各教研室分别下设有神经外科、胸外科、乳腺外科、甲状腺外科、肝胆外科、胃肠外科、儿科、妇产科、麻醉科、心血管内科、消化内科、呼吸内科、血液内科、眼科、耳鼻喉科、内镜中心、重症医学科等38个专业学科组。

 临床医学院是四川省教育工作先进集体，临床医学专业是教育部首批“卓越医生教育培养计划”（ 即“3+2”三年制专科临床医学教育人才培养模式改革）试点专业。临床医学院与直属附属安州区人民医院承担了学校各层次各专业的医学临床课程的教学任务，同时承担了医学相关各专业的临床实训、见习和实习带教任务。学院现有专任教师82人，其中教授、主任医师10名，副教授、副主任医师40名。在近20年普通专科办学历程中，为全国各地基层医疗卫生机构培养了近万名具有必备临床基础理论、专业基础知识和扎实临床医疗基本技能的高级医疗卫生人才。